Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM199Q8N511 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM199Q8N511 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM199Q8N511 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms