Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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