Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHTF2Q8N3S3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms