Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RPAP2Q8IXW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP2Q8IXW5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms