Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms