Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAINQ86UA6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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