Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMC1Q7Z7K0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMC1Q7Z7K0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC1Q7Z7K0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC1Q7Z7K0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms