Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSX7Q7RTT5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms