Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC80Q76M96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC80Q76M96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC80Q76M96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms