Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PREX2Q70Z35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PREX2Q70Z35 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms