Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP31Q70CQ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP31Q70CQ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP31Q70CQ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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