Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FGD6Q6ZV73 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
FGD6Q6ZV73 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FGD6Q6ZV73 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms