Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN12Q6ZSI9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms