Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LIAT1Q6ZQX7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIAT1Q6ZQX7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms