Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO4C1Q6ZQN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO4C1Q6ZQN7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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