Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP6Q6ZN66 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms