Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO3Q6UWJ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms