Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCIMPQ6UWF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms