Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPSL2Q6UWE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms