Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRSAM1Q6UWE0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRSAM1Q6UWE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms