Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms