Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZBED9Q6R2W3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBED9Q6R2W3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms