Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms