Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP4Q6PIL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms