Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C22orf39Q6P5X5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C22orf39Q6P5X5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms