Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN1Q6NZI2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms