Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP4Q6FHJ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SFRP4Q6FHJ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms