Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM68Q6AZZ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM68Q6AZZ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms