Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT39Q6A163 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT39Q6A163 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms