Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF3Q5VWG9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF3Q5VWG9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms