Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRCH2Q5VUJ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms