Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C12orf60Q5U649 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C12orf60Q5U649 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms