Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00242Q5T6M2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00242Q5T6M2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms