Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

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Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF19Q5SWL8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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