Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF14Q5SWL7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF14Q5SWL7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms