Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CEP170Q5SW79 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CEP170Q5SW79 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms