Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM240Q5SV17 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM240Q5SV17 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms