Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP188Q5SRE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms