Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD4BQ5PRF9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD4BQ5PRF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms