Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD3Q5JSP0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD3Q5JSP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD3Q5JSP0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
FGD3Q5JSP0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD3Q5JSP0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms