Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XKR4Q5GH76 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XKR4Q5GH76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XKR4Q5GH76 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms