Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SFT2D3Q587I9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D3Q587I9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms