Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms