Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRY2Q49AN0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms