Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT3Q3SXY7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT3Q3SXY7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms