Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM183BQ1AE95 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM183BQ1AE95 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms