Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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TNXAQ16473 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNXAQ16473 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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TNXAQ16473 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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TNXAQ16473 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TNXAQ16473 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNXAQ16473 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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