Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF56Q15929 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ZNF56Q15929 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ZNF56Q15929 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ZNF56Q15929 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ZNF56Q15929 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ZNF56Q15929 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF56Q15929 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF56Q15929 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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