Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWIST1Q15672 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TWIST1Q15672 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TWIST1Q15672 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TWIST1Q15672 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TWIST1Q15672 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWIST1Q15672 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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