Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF1Q15637 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF1Q15637 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF1Q15637 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF1Q15637 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF1Q15637 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SF1Q15637 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF1Q15637 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF1Q15637 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF1Q15637 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF1Q15637 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF1Q15637 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF1Q15637 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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